این بخش هم‌زمان با تأسیس بنیاد در سال 1378 آغاز به فعالیت نموده است و شامل تجهیزاتی مربوط به مباحث گوناگون علم فیزیک است که به زیرمجموعه‌های مجزایی تقسیم‌بندی شده است. غالب فعالیت‌های این گروه معطوف به تشریح آزمایش‌ها مهم مباحث فیزیک و برگزاری دوره‌های عملی- آموزشی است. آشنا نمودن بازدیدکنندگان به‌خصوص نوجوانان و جوانان دانش‌آموز با کاربردهای علم فیزیک در زندگی روزمره از یک‌سو و ایجاد انگیزه و تفهیم درست مباحث مبنایی فیزیک از اهداف مهم این بخش است. این بخش شامل زیرمجموعه‌هایی زیر میباشد:

• الکتریسیته و مغناطیس
• مکانیک
• اپتیک
• اخترشناسی و نجوم
• کارگاه آموزشی
• آزمایشگاه لیزر

مدیریت دپارتمان فیزیک از بدو افتتاح تاکنون بر عهده جناب آقای دکتر علی‌رضا خصالی (دکترای فیزیک و عضو هیات علمی دانشگاه مازندران) است. بخش فیزیک شامل آزمایشانی نظیر قانون پایستگی تکانه خطی، پایستگی انرژی، بررسی نیروها، قانون برنولی، آونگ‌ها، تیغه‌های تشدید، قانون هوک، قوانین تعادل، قانون ارشمیدس، قرقره‌ها، آزمایش ژیروسکوپ و … است.